El VIERNES 10 TERMINA EL PLAZO PARA EL ENVIO DE INFORMACIÓN DE PRODUCCIÓN  CIENTIFICA EN 2005.
GRACIAS A TODOS LOS USUARIOS POR EL TIEMPO DEDICADO A FACILITARNOS LA INFORMACIÓN DE SU TRABAJO. 

Contenido

• Ampliaciones en el Cluster SVG
• Informe de ejecución de trabajos
• Paradas no programadas en el servidor Superdome
• Ejecución de código MATLAB sin licencias disponibles: Compilador de MATLAB
• Nuevas aplicaciones instaladas y actualizaciones
• Enlaces esenciales.
  

Ampliaciones en el cluster SVG.    

Durante el mes de enero, se han llevado a cabo distintas ampliaciones del cluster SVG:

• Aumento de la memoria de 30 nodos a 2GB. De esta forma, es posible la ejecución de trabajos que demanden más memoria en este servidor, descargando así a los otros servidores que tienen más carga, como el Superdome y el HPC320
• Incorporación de 2 servidores DELL 1425 con dos procesadores Pentium Xeon64 a 3.2GHz y 3.0GHz y 2GB de memoria cada uno.
• Incorporación de un servidor HP Proliant DL145 con 2 procesadores dual core AMD Opteron a 1.8GHz

Para hacer uso de estos nuevos servidores no es necesario modificar nada en el modo habitual de enviar trabajos. Únicamente para enviar los trabajos al nodo Opteron es necesario añadir a las opciones habituales del qsub la opción “arch=x86_64”. Un ejemplo de envio al sistema de colas usando el nodo Opteron seria de la siguiente forma:

"qsub -l num_proc=1,s_rt=01:00:00,s_vmem=512M,h_fsize=1G,arch=x86_64 ejemplo.sh"

Informe de ejecución de trabajos     

• El JOBID del trabajo

• Código de salida (este número debe ser 0 si no ha habido ningún error de ejecución)

• El consumo de memoria del trabajo (útil para poder especificarlo al enviar trabajos a cola)

• El tiempo de ejecución

En caso de que tengan cualquier duda o problema con sus trabajos, es importante que incluyan esta información junto con el nombre del servidor y su login cuando se pongan en contacto con del departamento de sistemas o de aplicaciones para poder mejorar el análisis del problema.

Paradas no programadas en el servidor HP Superdome.     

Debido a distintos problemas nos compoñentes hardware do servidor Superdome, producíronse paradas non programadas neste superordenador os días 18, 25 (parada programada para substituir a peza defectuosa) e 30 de xaneiro. Rogamos desculpen os problemas ocasionados na execución dos traballos e aconsellamos aos nosos usuarios que só utilicen este servidor no caso de necesitaren as capacidades de multiprocesamento (varios procesadores por traballo) e de memoria (máis de 4GB por traballo) que ofrece. Para traballos que só utilicen 1 procesador ou menos de 2GB de memoria recomendamos utilizar os servidores HPC320 e o cluster SVG.

Ejecución de código MATLAB sin licencias disponibles: Compilador de MATLAB.     

Un problema habitual de los usuarios de MATLAB en el CESGA es el limitado número de licencias disponibles: Por ejemplo si en el HPC320 3 usuarios están utilizando MATLAB en un momento dado, un cuarto usuario debe esperar para ejecutar su código. Una solución a este problema estriba en el uso del compilador de MATLAB "mcc" para crear a partir de código MATLAB un programa independiente. Este programa es más rápido y no requiere una licencia de MATLAB para su ejecución…. [Descargar Fichero PDF *]


*Necesario Acrobat reader [Versión para Windows, Linux eMac]

Nuevas aplicaciones instaladas y actualizaciones.    

Instalada la nueva versión (2006) y actualización (Enero 2006) de Cambridge Structural Database (CSD). Información detallada sobre esta nueva versión se puede encontrar en el siguiente enlace.

Instalada la versión de Matlab 7.1 para Linux x86-64 en el SVGD. Esta versión permite la ejecución de Matlab en los nuevos nodos de reciente incorporación en el SVGD aprovechando su nuevo potencial. Para más información sobre Matlab consultar la sección de aplicaciones en la página principal del CESGA.

Instalada el paquete de compiladores (C, C++, Fortran 77/90/95) PathScale EKOPath en el nuevo nodo opteron incorporado en el SVGD. Este compilador está considerado el de más alto rendimiento para las arquitecturas AMD64 y EM64T.

Enlaces esenciales.     

Documentación y manuales de los sistemas de cálculo, almacenamiento y aplicaciones:

http://doc.cesga.es

Uso del sistema de colas en el CESGA:

http://www.cesga.es/content/view/431/53/

Guía básica de Unix:

http://iie.fing.edu.uy/~vagonbar/unixbas/

FAQs de computación:

http://www.cesga.es/component/option,com_simplefaq/Itemid,16/

Monitorización en tiempo real (máximo 30 minutos de retardo) del estado de los servidores y las colas:

Estado sistemas

Como solicitar ayuda:

 : para cualquier aspecto relacionado con los servidores de cálculo, sistemas de colas, almacenamiento, etc…

: en caso de consultas relacionadas con el uso de aplicaciones, peticiones de nuevas aplicaciones, etc…