Instalouse nos servidores HPC 4500 y AP 3000 do CESGA a aplicación GeneHunter. Esta aplicación dá solución a problemas de optimización que utilizan as metodoloxías máis avanzadas de algoritmia xenética (multipoint analysis of pedigree data including: non-parametric linkage analysis, LOD-score computation, information-content mapping, haplotype reconstruction).
O uso de GeneHunter adáptase as necesidades de bioinformáticos, biólogos, médicos, xenetistas, etc
A licencia desta aplicación é FreeWare e o código fonte da aplicación atópase dispoñible. Non hai versión paralela, ainda que se compilou para o HPC4500 coa opción -xautopar a versión 2.1r2. Para usala neste caso tense que executar gh.cc.par..Co que se mellora nun 25% o tempo de execución.
Cambios de contorno:
1. Para usar a versión 2.0 engadir ó PATH o directorio /opt/cesga/GeneHunterv2.0
2. Para usar a versión 2.1 r2 engadir ó PATH o directorio /opt/cesga/GeneHunterv2.1r2
cesga.es
:: Telf.: +34 981 569810 - Fax: 981 594616 ::
Avda. de Vigo s/n 15705, Santiago de Compostela.